秘书处——秘书处为协会常设办事机构，负责具体落实会员大 会、理事会、常务理事会、会长办公会等各项决议，承担协会的日常工作。 秘书长负责秘书处日常工作，要服从大局，尽职尽责，忠实勤勉，加强团结。秘书处要运转高效，具有较强执行力，其职责：
一、 了解、掌握协会贯彻执行党和国家的法律、法令和政策情况，掌握会员单位工作动态，为协会领导决策提供依据和提出建议。
二、 负责协会各类会议的记录、整理，编发会议纪要，负责组织对会议有关决议的实施；及时督查和反馈重要会议、文件精神和重要事项的贯彻落实情况。
三、 负责起草、印发各类文件、报告、总结及其他材料，包括规章制度的拟定、修改和编写工作；负责组织编写协会年度大事记。
四、 协助秘书长组织安排好协会的各种工作会议和大型活动。
五、 负责与海外工商社团和省内外社会组织建立友好协商关系。
六、 负责与省委统战部、省工商联、省民政厅及上级党委、政府有关部门的请示报告和联络工作。
七、 负责本会社团管理方面有关材料的年检和报告工作。
八、 协调协会各部门之间关系，团结协作，形成共识，共同做好协会的各项工作。
九、 协调处理协会日常事务，负责组织内外联络，组织安排各种会议和活动；协助会长、秘书长做好重要来宾的接待工作。
十、负责本会年度财务审计和日常财务管理工作，严格财务管理制度, 办理开支审批手续，建立健全财务档案。
十一、保管协会印章，严格按规章制度用印。
十二、负责协会文书档案工作，定期整理归档。
十三、负责协会网站和微信公众平台内容更新。
十四、负责编辑印发《山东民企之家》会刊。
十五、完成省委统战部、省工商联、省民政厅安排的有关活动和协会领导交办的工作。

     会员发展委员会——发展新会员, 吸引省内更多的优秀企业家加入到山东省民营企业家协会队伍中来。在对民营企业进行调研的基础上，真正了解民营企业的需求、发展中遇到的困难和问题，为协会会员企业发展提供有价值的建议及决策依据，为民营企业提供各类有价值的培训和服务，逐步提升会员企业的治理能力和管理水平。
     企划委员会（工会委员会）——组织策划宣传活动，树立民企品牌形象，加强与会员企业工会的联系，维护协会和会员企业职工的合法权益，参与企业的民主管理，教育职工不断提高思想道德素质和科学文化水平，建设“四有”职工队伍。宣传会员企业科技创新、扶贫助困、吸纳就业等方面的典型经验和做法，打造民营企业品牌，增强协会的凝聚力和影响力,引领社会各界尊重、支持、关心民营企业，为民营企业发展提供更好的环境。
     维权委员会——主要负责与法院、检察院、公安部门、司法部门、律师协会及政府相关部门建立起沟通平台，为民营企业提供法律维权，法律服务，法律援助，仲裁调解等，建立“民营经济法律风险防范体系”。
     合作发展委员会——主要负责为会员企业提供合作发展机遇，促进会员企业发展。通过多渠道建立与全国有影响力商协会沟通协调，建立友好关系和战略合作关系。加强与省内行业商协会、异地商协会等社会组织密切联系，联合共同举办各类活动、论坛、讲座等。
     青年委员会（团支部）——以“传承、创新、融合” 为宗旨，继承和弘扬企业家精神，积极开展理想信念教育活动，引导青年企业家听党话、跟党走、接好班。主动与团省委和会员企业团组织沟通联系，团结会内外青年企业家，开展经济、科技、文化交流与合作，充分把握当代青年的特点和青年工作规律，更好地团结青年，教育青年，引导青年，服务青年，为青年创业发展创造良好条件，为青年健康成长和事业发展做好服务。
     专家咨询委员会——对协会建设和发展提供智力支持；对协会年度工作计划和重要工作提出意见和建议；代表协会参与省委统战部、省工商联等有关部门的重大活动或重要会议；参与协会重要工作、重点会议和重大活动；参与协会重点课题调研，建言献策。
     海外发展委员会——深入开展调查研究，了解掌握民营企业在国外开展投资合作的基本情况、方式、特点和障碍以及需求情况。积极引导民营企业参与“一带一路”建设，引导民营企业在完善经营管理体系、依法合规诚信经营、加强境外风险防控等规则下开展境外投资。协助和支持山东省工商联等部门组织开展的相关外事服务活动，为民营企业走出去提供有效服务。